Kể từ năm 2013, IMP gặp phải những khó khăn nhất định khi thực hiện Thông tư liên tịch số 01/2012/TTLT-BYT-BTC do Bộ Y tế và Bộ Tài chính ban hành, hướng dẫn đấu thầu mua thuốc trong các cơ sở y tế.